超やばい

遺伝子関係の授業をとった
それも二つ
・・・やばいくらい選択ミスりました
これ逝ける
ほかのみんなもどんどん脱落してるぞ
修羅場だ修羅場
多分 生徒全員理解してない
現在2〜3人しか学生がいなくなった
さすがに全員落とすわけにもいかないだろう
この一週間で理解してレポートを出す
これしかない


ということで勉強中なのだが

blastは2本の配列を比較し、アライメントをとるプログラムです。
一般に、2本の配列の比較を行うためには、ギャップを入れた最適なアライメントをとる必要がありますが、これには時間がかかります。そこで、時間短縮のために用いられているのが、HSP(High-Scoring Segment Pair)と呼ばれるものです。これは、ギャップを入れずに高いスコアを与える部分配列の対(局所的なアライメント)のことです。

2本の配列間に存在するHSPを高速に見つけるため、blastでは、問い合わせ配列(queryと呼びます)から固定長の断片(cf.Word-length)を抜き出し、これらと類似の配列断片をデータベースの中から見つけ、その断片どうしのアライメントを両側に伸ばしていき、これをHSPとします。さらに、現バージョンのblastでは、この探索部分をtwo-hit法と呼ばれる方法で改良し、高速化を図っています。


60、70くらいしかわからない・・・
これ読んで100%わかるやつは天才だと思った